采用直透路线可让车资平均减少约15%。长远而言，地铁能源消耗也较少。

有学者认为，综合考虑成本效率及环境因素后，直透路线是最合理的决定。对于被指只考虑经济效益，总理公署部长兼财政部及教育部第二部长英兰妮说，直透路线隧道深达70米，建设成本更高，说明政府不只考虑经济效益，也听取环保人士的建议，做了妥协。

交通部之前提出两个选项，即在直透路线穿过中央集水区，或在中央集水区边缘绕道而过，两条路线都须挖掘隧道。直透路线的隧道最深达70米左右，全程在花岗岩石层挖掘，以减少施工造成的震动及避免土壤移动。环境评估结果显示，只要采取缓解措施，如禁止将工地污水等排入连接至河流的水沟等，直透路线对环境的影响可降至轻微或适中水平。

政府公布决定后，有人欢喜有人忧。欢喜的是原本担心受绕道路线影响的居民；一些人则仍然担心直透路线会对大自然造成破坏。

政府经过六年的公众咨询和深入研究，去年12月敲定地铁跨岛线横越新加坡中部的关键路线，直透穿过中央集水区地底。