柯文哲的说法在网上引发论战。台湾网络论坛批踢踢实业坊（PTT）上，就有网民质疑柯文哲在搞个人崇拜；但也有人认为，柯文哲是用耶稣会比喻情操，而非指宗教信仰。也有不少媒体人讥讽柯文哲想当耶稣。
柯文哲说，耶稣会不是耶稣所创立，而是西班牙人罗耀拉创办。他表示，自己那段话的愿意是希望政治团体也能有崇高的理想和道德，要劝人为善而非劝人为恶；希望大家能共融不是对立，让不同的人融合在一起。
台湾民众党总统候选人柯文哲近日提到要将民众党弄得像“耶稣会”一样，“有思想、有信仰”，被多名媒体人讥讽。柯文哲星期天（12月17日）称，最近自己一直被媒体诬陷想当耶稣，“简直就是媒体乱打”，失去公平媒体是台湾政治最大的问题。
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综合台湾中时新闻网和NewTalk新闻网报道，柯文哲星期天在网络直播节目受访时说，最近很多媒体、名嘴每天都在诬陷自己想当耶稣，但他们都“不知所云颠倒是非”。
柯文哲上星期三（12月13日）接受台湾资深媒体人范琪斐的专访时谈到，自己常说要把民众党弄得像耶稣会一样有思想、有信仰，并指耶稣会是全世界第一家跨国公司，民众党要有那种文化。他认为，民众党比较像企业，不太像政治组织。
他说，民进党之所以堕落得那么快，很大理由是媒体被控制。绿营以前在野时期喊出党政军退出媒体，执政后党政军就是媒体，而台湾国家通讯传播委员会（NCC）失能的很大原因是媒体不再作为台湾的第四权，赖清德老家涉嫌违建不会报，行政院副院长郑文灿疑似开房的影片报道两天就没了，“失去公平媒体是台湾政治最大问题”。
柯文哲也反问民进党总统候选人赖清德对亲绿的镜电视公然表示成立频道是总统蔡英文的指示；三立新闻台、公视消音柯文哲，双标有什么看法？他也质问国民党总统候选人侯友宜对朋友经营媒体，做出偏颇报道有何看法？
