虽然收视高，但剧集播出后，因为四大争议被韩国观众骂翻：
2.‘歪曲历史’
4.主角受争议
3.不尊重韩国国宝
丰壤赵氏（历史上“神贞王后”）在韩国历史上是实际存在的人物，所以名门后人“丰壤赵氏宗亲会”对于该剧污化王后的行为表示不满，目前他们表示将对歪曲历史的电视剧《哲仁王后》采取应对措施。
《太子妃升职记》改编自中国网络作家“鲜橙XC”的同名小说，但鲜橙在另一部小说《和亲公主》中却用“高丽棒子”贬低称呼高丽使臣，且该小说中还表现出了对韩服的蔑视。韩国网友表示剧集翻拍自“辱韩”作者的作品而感到不满。
《哲仁王后》争议还在不断发酵，韩国节目通信审议会已收到763件关于该剧的投诉，观众们不满的主要内容是剧中存在歪曲历史和文化遗产的行为，以及疑似性骚扰（丰壤赵氏夸张的行为被认为有性骚扰嫌疑）的行为。通信审议委员会方面表示具体处理结果需要讨论后再做决定。
13日播出的《哲仁王后》中，穿越为王后的张奉焕与哲宗在初夜当晚并未圆房，而是避开了彼此，但是历史记载中哲宗是近酒色的人，与历史不符。
剧中从现代穿越至古代的张奉焕剧中吐槽表示“《朝鲜王室实录》也不过是小道消息”，引发网友不满，因为《朝鲜王朝实录》又称《李朝实录》，记载了朝鲜王朝始祖太祖到哲宗的25代472年（1392-1863）的历史。该史书1997年10月被联合国教科文组织登记为世界记忆项目，亦被列入韩国国宝第151号。
对此，《哲》剧导演在制作发表会上划清界限表示：“将只留用现代男子穿越到王后身上的这个设定，后续的故事是完全不同的”，但依旧未能消除网友不满。
韩国网友认为虽然电视剧开头曾注明“登场的人物、团体、事件等与历史事实无关，是虚构创作的”，但《哲仁王后》中的人物都是历史上真实的人物，所以不应该过度脱离现实。
女主角申惠善在制作发表会袒露自己接这部剧的原因时曾表示：“我觉得如果不出演的话可能会后悔，所以就决定挑战了”。但网友们认为剧集很多争议，对她的想法表示十分失望，也有网友缓颊：“可能电视剧确实有趣没想到会引发争议吧！”
收763投诉
另外丰壤赵氏（大妃）在剧中被描述成是十分迷信的女人，她利用符咒对女主哲仁王后进行了诅咒，她向女主描绘如何才能生育子嗣的“19禁”场面也十分夸张。
由申惠善、金正贤主演的韩剧《哲仁王后》12月12日正式在tvN播出，首播第一集便获得8.03%高收视，甚至超越大热韩剧《爱的迫降》的首播6.074%成绩！剧集改编自中国爆红网剧《太子妃升职记》，讲述男子身份的青瓦台厨师，穿越到朝鲜时代，灵魂困在“哲仁王后”金素容身体内，与中国版设定相似。
